在“Ｘ檔案”第八季的最終回，神祕懷孕的史卡利探員（姬蓮安德森飾）終於產下一名男嬰，他們也證實了調查局的確和外星人的陰謀有關。在第九季開始時, 史卡利的寶寶打開了潘朵拉的寶盒…她的寶寶是人類嗎？外星人為什麼對她的寶寶這麼有興趣？

過去八年來穆德探員（大衛杜考夫尼飾）和史卡利遭遇過不計其數的神祕現象、怪獸和外星生物，有的詭異，有的卻看來十分平凡。這部前無古人後無來者的影集為科幻影集下了全新的定義。在上一季裡，史卡利探員和她的新搭檔聯手調查穆德探員被外星人綁架的神祕事件，並成功地救回穆德探員，讓他脫離外星人的掌控。

外星人入侵的威脅與日俱增，史卡利必須解開她神祕懷孕的謎團，並調查她腹中胎兒和外星人陰謀間的關係。

1993年開播的“Ｘ檔案”如今已成為風行全球的文化現象，並贏得三座金球獎，分別是最佳劇情類影集、最佳劇情類影集男演員獎（大衛杜考夫尼）和最佳劇情類影集女演員獎（姬蓮安德森）。

“Ｘ檔案”自開播後入圍艾美獎的次數高達61次，並多次榮獲艾美獎，贏得的獎項包括劇情類影集最佳女主角獎（姬蓮安德森），劇情類影集最佳編劇、劇情類影集最佳美術指導、劇情類影集最佳化妝、單機拍攝最佳剪接獎和影集類最佳音效剪接。“Ｘ檔案”也曾榮獲美國廣播電視文化成就。